Penggunaan teknologi informasi dalam pelayanan kesehatan melalui aplikasi E-Puskesmas merupakan salah satu upaya untuk meningkatkan efektivitas kerja dan kualitas pelayanan kesehatan. Namun, dalam pelaksanaanya masih terdapat beberapa kendala seperti gangguan sistem, keterbatasan kemampuan pegawai dalam mengoperasikan aplikasi, serta sebagian pegawai menganggap penggunaan aplikasi menambah beban kerja ketika terjadi kendala sistem. Berdasarkan hal tersebut, penelitian bertujuan untuk mengetahui apakah terdapat pengaruh dan seberapa besar pengaruh efektivitas aplikasi E-Puskesmas terhadap kinerja pegawai di Unit Pelaksan Teknis (UPT) Puskesmas Rawat Inap Danau Panggang Kabupaten Hulu Sungai Utara. Penelitian ini menggunakan pendekatan kuantitatif dengan tipe penelitian asosiatif. Populasi dalam penelitian ini adalah seluruh pegawai pengguna aplikasi E-Puskesmas di UPT. Puskesmas Rawat Inap Danau Panggang sebanyak 75 orang dengan jumlah sampel sebanyak 58 responden yang ditentukan dengan menggunakan teknik probability sampling melalui metode simple random sampling. Teknik pengumpulan data dilakukan melalui observasi, kuesioner (angket), dan dokumentasi. Data penelitian dianalisis menggunakan uji validitas, uji reliabilitas, uji asumsi klasik, analisis regresi linier sederhana, uji hipotesis (uji t), dan uji koefisien determinasi dengan bantuan aplikasi IBM SPSS Statistics.